AirPods Pro 在推出之後一共經歷了兩次固件更新，分別為 2019 年 11 月份取代了 2B584 出廠版本的 2B588，以及 2019 年 12 月份的 2C54。由於蘋果沒有給具體的更新信息，所以圍繞著這兩個版本是否會影響耳機性能，特別是降噪表現的傳言也甚囂塵上。
國內科技媒體曾經將運行 2B588 版本的 AirPods Pro 與運行出廠版本（2B584）的進行了對比測試，得出了新固件（2B588）對 AirPods Pro 降噪性能影響不大的結果，而外媒通過測試也同樣給出了類似的結論。
但問題可能出在去年 12 月份推送的 2C54 版本上，從外媒進行的對比測試來看，這個固件版本似乎對 AirPods Pro 的降噪表現產生了一些副作用：「更新到 2C54 固件後，我們重新測試了 AirPods Pro。結果表明，運行新固件的 AirPods Pro 的降噪性能下降了很多，主要是在低音範圍內。這意味著打開主動降噪的情況下，AirPods Pro 在隔絕飛機或其他設備的引擎發出的隆隆聲方面的效果變差了。」外媒在 1 月 10 日的測試中寫道。
但另一方面，2C54 固件似乎在一定程度上提升了 AirPods Pro 的低音表現，因為從對比測試來看，數據顯示運行新固件的 AirPods Pro 在低音準度方面有了很大提升，此外頻率響應一致性方面也要比之前好一些。
蘋果似乎已經撤回了 2C54 固件，因為許多 AirPods Pro 用戶表示自己沒有收到該固件推送。要查看自己的 AirPods 固件版本號，可以前往「設置 > 通用 > 關於本機 > AirPods」。